Alle probiotika er delt inn i flere grupper avhengig av hva som ligger til grunn for klassifiseringen. Et probiotikum kan inneholde flere komponenter, i denne forbindelse skilles det ut monokomponentpreparater, som bare har én spesifikk type bakterier. Disse mikroorganismene er utvilsomt nyttige for tarmene, spesielt for mikrofloraen.