Hovedretningene for medikamentell behandling av myokarditt bestemmes av hovedleddene i patogenesen til myokarditt: infeksjonsindusert betennelse, utilstrekkelig immunrespons, død av kardiomyocytter (på grunn av nekrose og progressiv dystrofi, myokardittisk kardiosklerose) og forstyrrelse av kardiomyocyttmetabolismen. Det bør tas i betraktning at myokarditt hos barn ofte forekommer på bakgrunn av kronisk fokal infeksjon, som blir en ugunstig bakgrunn (forgiftning og sensibilisering av kroppen), noe som bidrar til utvikling og progresjon av myokarditt.