Ny metode vil gjøre det mulig å utvikle legemidler raskere

En internasjonal gruppe forskere fra Frankrike, Amerika og Russland har utviklet en ny unik metode for å lage legemidler som skiller seg fra de som finnes i dag i hastighet. Takket være den nye metoden for modellering av interaksjoner mellom proteiner, vil det være mulig å fremskynde prosessen med å utvikle vaksiner og legemidler, og biokjemikere vil også ha et nytt potensial for å drive forskning.

Nå står forskere overfor oppgaven med å utvikle slike legemidler som ikke forårsaker bivirkninger, absorberes fullstendig av kroppen og bare ødelegger usunne celler. For en celle er protein det viktigste byggematerialet, i én celle er det mange interaksjoner (hundretusenvis), og studiet av disse prosessene vil tillate forskere å utvikle nye metoder for behandling av farlige sykdommer, lage nye biologiske materialer for oppfinnelsen av legemidler.

Spesialister fra forskjellige land, under ledelse av professor Dmitrij Kozakov fra Stony Brook University, klarte å lage og studere en datamodell som er i stand til å beregne strukturer dannet under samspillet mellom to proteiner flere ganger raskere (den nye modellen er titalls ganger raskere enn lignende systemer som finnes i dag).

Ifølge forskere er laboratoriestudier ganske dyre, siden de krever reagenser og dyrt utstyr. For små forskningsgrupper er det beste alternativet datamodellering. Det finnes for tiden mange datasystemer som beregner interaksjonen mellom proteiner, men dessverre er ikke alle eksisterende systemer i stand til å beregne et stort antall proteininteraksjoner på kort tid. Alle algoritmer som for tiden brukes til å overvåke konfigurasjoner separat, uten å kombinere dem, og den nye metoden til professor Kozakovs team tillater analysering av alle komplekser samtidig på kort tid, og dette gjør det mulig å akselerere prosessen opptil 100 ganger uten å påvirke kvaliteten på det endelige resultatet.

Ved å bruke en datamodell som grunnlag vil spesialister ikke bare kunne utvikle legemidler raskere, men også redusere kostnadene betydelig. Den nye metoden for datamodellering lar ikke bare beregne proteininteraksjoner, men også analysere strukturen til levende organismer (både dyr og mennesker). Ifølge spesialister vil den nye metoden tillate utvikling av effektive legemidler mot HIV og onkologiske sykdommer, og på kort tid vil det være mulig å fremstille et tilstrekkelig antall legemidler.

Forskerne publiserte en artikkel med resultatene av arbeidet sitt i et av de vitenskapelige tidsskriftene, der spesialistene beskrev i detalj en ny metode for datamodellering av proteininteraksjoner.

Dette arbeidet er ikke ment for kommersiell bruk, men er en grunnleggende studie, slik at vi kan snakke om arbeidet som er gjort fra det øyeblikket det publiseres i en vitenskapelig publikasjon. Nå brukes den nye algoritmen allerede på den offentlige ClusPro-serveren som et nytt datasystem og er tilgjengelig for alle.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ]