Forskere har identifisert et potensielt mål for en fremtidig hiv-vaksine

Humant immunsviktvirus har klart å unnslippe vaksineprodusenter i 30 år, delvis på grunn av dets utrolige evne til å mutere, slik at det enkelt kan omgå eventuelle forhåndsbestemte hindringer.

Men nå ser det ut til at forskere fra Massachusetts Institute of Technology og Reagon Institute (begge i USA) har klart å finne en lovende strategi for utformingen av en fremtidig vaksine som bruker en matematisk tilnærming som har blitt testet med hell for å løse problemer innen kvantefysikk, så vel som i analysen av prissvingninger i aksjemarkedet.

Vaksiner lærer immunforsvaret å reagere umiddelbart på spesifikke molekylære egenskaper ved patogener. Men evnen til humant immunsviktvirus (HIV) til å mutere gjør det praktisk talt umulig å velge riktig vaksine. I jakten på en ny strategi bestemte forskere seg for å droppe å målrette individuelle aminosyrer. I stedet satte de seg fore å identifisere uavhengig utviklende grupper av aminosyrer i proteiner, hvor aminosyrer utvikler seg i tandem innenfor hver gruppe, det vil si «ser på hverandre» for å opprettholde virusets levedyktighet. Forskerne var spesielt vedvarende i å søke etter slike grupper, der utviklingen innenfor ville ha størst sjanse for å ende i HIVs kollaps – dets videre manglende levedyktighet. Ved å utføre et mangesidig angrep på nettopp slike steder i viruset, ville det deretter være mulig å fange det «mellom to bål»: enten ville det bli kvalt av immunforsvaret, eller det ville mutere og selvdestruere.

Ved hjelp av tilfeldig matriseteori lette teamet etter evolusjonære begrensninger i det såkalte Gag-proteinsegmentet av HIV, som danner proteinskallet til viruset. De trengte å finne kollektivt utviklende grupper av aminosyrer med et høyt nivå av negative korrelasjoner (og et lavt antall positive, slik at viruset kan overleve), når flere mutasjoner ødelegger viruset. Og slike kombinasjoner ble funnet i en region som forskerne selv kalte Gag-sektor 3. Den er involvert i å stabilisere proteinskallet til viruset, så flere mutasjoner på dette stedet er fylt med kollaps av virusstrukturen.

Interessant nok, da forskere så på tilfeller av HIV-smittede personer som naturlig var i stand til å bekjempe viruset, fant de at immunforsvaret til disse pasientene angrep fortrinnsvis i Gag-segment 3.

Forfatterne prøver nå å finne andre lignende regioner i virusets struktur utenfor Gag-sektoren, og utvikler også elementer av de aktive komponentene i en fremtidig vaksine som vil lære immunforsvaret å reagere umiddelbart på tilstedeværelsen av Gag-sektor 3-proteiner og umiddelbart angripe det på riktig måte.

Dyreforsøk er det neste, men foreløpig vil alle detaljene i arbeidet bli presentert på den 56. årlige konferansen til Biophysical Society, som avholdes 25.–29. februar i San Diego, California, USA. Et sammendrag av presentasjonen er tilgjengelig på denne lenken.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ], [ 5 ], [ 6 ], [ 7 ], [ 8 ]