Studie: gener påvirker effekten av frukt og fiber mot kreft

En nylig studie publisert i tidsskriftet eBioMedicine har identifisert genetiske variasjoner som kan endre sammenhengen mellom inntak av fiber, frukt og grønnsaker og risiko for kolorektal kreft (CRC). Forskerne identifiserte to signifikante loci som endrer sammenhengen mellom inntak av fiber og frukt og risiko for kolorektal kreft.

Kolonial kronikk (KRC) er en av de vanligste kreftformene i verden, med nesten to millioner nye tilfeller og over 900 000 dødsfall i 2020. Høyt inntak av frukt, grønnsaker, fullkorn og kostfiber har vist seg å redusere risikoen for KRC. Selv om det finnes sterke bevis for en sammenheng mellom KRC-risiko og inntak av fullkorn og kostfiber, er bevisene for en sammenheng mellom KRC-risiko og inntak av frukt og grønnsaker fortsatt begrenset.

Tidligere genomomfattende assosiasjonsstudier (GWAS) har identifisert minst 200 loci assosiert med CRC-risiko, noe som forklarer opptil 35 % av arveligheten. Selv om gen-miljø (G × E)-interaksjoner kan forklare ytterligere arvelighet, har tidligere studier med små utvalg og tradisjonelle metoder bare funnet et begrenset antall signifikante interaksjoner. Nye statistiske tilnærminger, som konjunksjonstester og totrinnsmetoder som prioriterer enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP-er), har potensial til å forbedre nøyaktigheten til disse analysene.

Opptil 45 studier fra tre genetiske konsortier for kreft, inkludert individer av europeisk avstamning, ble inkludert i analysen. Studiene inkluderte kasus-kontrollsett for kohortstudier og kreftfrie kontroller for kasus-kontrollstudier. Totalt 69 599, 69 734 og 44 890 deltakere ble analysert for henholdsvis frukt-, grønnsaks- og fiberinntak. Kostholdsinntaket ble vurdert ved hjelp av spørreskjemaer om matfrekvens og kostholdshistorikk, vanligvis uttrykt som porsjoner per dag for frukt og grønnsaker og gram per dag for total fiber.

Dataene ble harmonisert og uttrykt som kvartilverdier etter kjønn og studie. I tillegg inkluderte genotypingskvalitetskontrollen kontroll av manglende data, Hardy-Weinberg-likevekt og kjønnsavvik, etterfulgt av imputasjon og filtrering for mindre allelfrekvens og nøyaktighet, noe som resulterte i en analyse av 7 250 911 SNP-er.

Sammenlignet med kontrollgruppen var deltakerne med CRC eldre, hadde høyere kroppsmasseindeks og energiinntak, og en høyere forekomst av risikofaktorer som familiehistorie med CRC og type 2-diabetes. De konsumerte også mindre fiber, frukt og grønnsaker sammenlignet med kontrollgruppen. Metaanalyser fant en invers sammenheng mellom fiberinntak (relativ risiko per kvartil økning (OR) = 0,79), frukt (OR = 0,79) og grønnsaksinntak (OR = 0,82) og CRC-risiko.

3-DF-testen identifiserte rs4730274-lokuset oppstrøms for SLC26A3-genet, som viser en assosiasjon med fiberinntak og en interaksjon med CRC-risiko. Stratifisering etter genotype viste en sterkere invers assosiasjon mellom fiber og CRC for hver kopi av T-allelet. Funksjonell annotering antydet enhanceraktivitet i kolonvev, med en eQTL for DLD-genet.

Rs1620977-lokuset nær NEGR1-genet viste en signifikant assosiasjon med fruktkonsum og en moderat interaksjon med CRC-risiko. Sterke inverse assosiasjoner ble observert med økende fruktkonsum for hver kopi av G-allelet.

Studien er den største G×E-studien hittil, der forskerne identifiserte to interaksjoner mellom fiber, fruktinntak og risiko for kreft i tarmen (CRC). Mer spesifikt antyder rs4730274 nær SLC26A3-genet en signifikant sammenheng mellom fiberinntak, tarmfunksjon, betennelse og CRC. Resultatene krever videre studier for å undersøke de kliniske implikasjonene og bekrefte disse funnene i ulike populasjoner.